სამინისტროს საქმიანობის ფარგლებში დეპარტამენტის ძირითადი ამოცანებია:

1. აფხაზეთიდან იძულებით გადაადგილებულ პირთა ჯანმრთელობის მდგომარეობის გაუმჯობესებისა და სოციალურ საკითხთა დარეგულირებაში მონაწილეობის მიზნით, ჯანდაცვითი და სოციალური პროფილის პროგრამების შემუშავება;

2. სამინისტროში მოქმედი ჯანდაცვითი და სოციალური პროფილის პროგრამების კოორდინაცია და მონიტორინგი;

3. სამინისტროს სისტემაში შემავალი სამედიცინო დაწესებულებების საქმიანობის ხელშეწყობის მიზნით, შესაბამისი მოქმედებების განხორციელებ