დეპარტამენტის სტრუქტურული ქვედანაყოფებია:
ა) საფინანსო-საბიუჯეტო სამმართველო;
ბ) ბუღალტრული აღრიცხვისა და ანგარიშგების სამმართველო;
გ) სახელმწიფო შესყიდვების სამმართველო;
დ) ლოჯისტიკისა და მატერიალურ-ტექნიკური უზრუნველყოფის სამმართველო;
დ.ა) აქტივებისა და ინვენტარიზაციის მართვის განყოფილება;
დ.ბ) სატრანსპორტო და ტექნიკურ საშუალებათა უზრუნველყოფის განყოფილება;
ე) საარქივო სამმართველო;
ვ) ინფრასტრუქტურის განვითარების სამმართველო;
ზ) საქმისწარმოების სამმართველო;
თ) შრომის უსაფრთხოების განყოფილება.
შემოსავლების სამსახურის უფროსის 2012 წლის 12 მარტის ბრძანება №3559 - ვებგვერდი, 19.03.2012წ.
შემოსავლების სამსახურის უფროსის 2014 წლის 6 მარტის ბრძანება №13119 - ვებგვერდი, 14.07.2014წ.
შემოსავლების სამსახურის უფროსის 2016 წლის 16 მარტის ბრძანება №6701 - ვებგვერდი, 16.03.2016წ.
შემოსავლების სამსახურის უფროსის 2017 წლის 22 სექტემბრის ბრძანება №24933 - ვებგვერდი, 29.09.2017წ.
შემოსავლების სამსახურის უფროსის 2019 წლის 29 აგვისტოს ბრძანება №30203 - ვებგვერდი, 03.09.2019