1. კომისიის საქმიანობის ორგანიზებასა და ყოველდღიურ საქმისწარმოებას უზრუნველყოფს კომისიის აპარატი.
2. კომისიის აპარატის სტრუქტურული ერთეულებია:
ა) მრჩეველთა საბჭო;
ბ) დეპარტამენტი;
გ) კომისიის თავმჯდომარისა და კომისიის წევრის აპარატი.
3. კომისიის აპარატის დეპარტამენტში შეიძლება ჩამოყალიბდეს ერთი ან რამდენიმე ქვედანაყოფი – სამმართველო.
4. კომისიის აპარატში იქმნება შემდეგი დეპარტამენტები:
ა) ელექტროენერგეტიკის დეპარტამენტი;
გ) ბუნებრივი გაზის დეპარტამენტი;
დ) წყალმომარაგების დეპარტამენტი;
ე) ტარიფებისა და ეკონომიკური ანალიზის დეპარტამენტი;
ვ) იურიდიული დეპარტამენტი;
ზ) რეგულირების განვითარებისა და მეთოდოლოგიური უზრუნველყოფის დეპარტამენტი;
თ) მომხმარებელთა საჩივრების დეპარტამენტი;
ი) ბაზრის მონიტორინგის დეპარტამენტი;
კ) მომსახურების კომერციული ხარისხის კონტროლის დეპარტამენტი;
ლ) საზოგადოებასთან ურთიერთობის დეპარტამენტი;
მ) საერთაშორისო ურთიერთობათა დეპარტამენტი;
ნ) ადამიანური რესურსების მართვისა და საქმისწარმოების დეპარტამენტი;
ო) შესყიდვების, ქონების მართვისა და ლოჯისტიკის დეპარტამენტი;
პ) საფინანსო-საბიუჯეტო დეპარტამენტი;
ჟ) კომპიუტერულ-ტექნიკური და პროგრამული უზრუნველყოფის დეპარტამენტ