დეპარტამენტის სტრუქტურული ერთეულებია:

ა) ნარკოტიკების უკანონო ბრუნვის წინააღმდეგ ბრძოლის მთავარი სამმართველო;

ბ) ორგანიზებულ დანაშაულთან ბრძოლის მთავარი სამმართველო;

გ) ოპერატიული საქმიანობის კონტროლის, ანალიზისა და ორგანიზაციული უზრუნველყოფის მთავარი სამმართველო;

დ) სამართალდაცვით სფეროში საერთაშორისო თანამშრომლობის ცენტრი (მთავარი სამმართველო);

ე) სპეციალური ღონისძიებების სამმართველო;

ვ) სპეციალურ დავალებათა სამმართველო;

ზ) საერთო განყოფილება (კანცელარია