1. აკადემიის მიზნებია:
ა) საქართველოს კანონმდებლობით, საერთაშორისო კონვენციებით, ხელშეკრულებებით და შეთანხმებებით დადგენილი სტანდარტების შესაბამისად უმაღლესი განათლების მქონე კადრების მომზადება საზღვაო ტრანსპორტის ინდუსტრიისათვის;
ბ) პიროვნების ინტერესებისა და შესაძლებლობების შესატყვისი უმაღლესი განათლების მიღების, კვალიფიკაციის ამაღლებისა და გადამზადების მოთხოვნილებათა დაკმაყოფილება;
გ) ქვეყნის განვითარებისა და საკუთრივ უმაღლესი განათლების სისტემის სიცოცხლისუნარიანობის უზრუნველსაყოფად მაღალი კვალიფიკაციის სპეციალისტების მომზადება და გადამზადება, სამეცნიერო კვლევის პირობების შექმნა და განვითარება.
2. თავისი მიზნების შესასრულებლად აკადემია:
ა) ახორციელებს დიპლომირებული სპეციალისტის, საბაკალავრო, სამაგისტრო და სადოქტორო საგანმანათლებლო პროგრამებს;
ბ) ახორციელებს საგამომცემლო საქმიანობას, აქვეყნებს ორიგინალურ თუ თარგმნილ სახელმძღვანელოებსა და სამეცნიერო ნაშრომებს;
გ) ახორიციელებს დამხმარე სამეწარმეო და ეკონომიკურ საქმიანობას;
დ) ახორციელებს პროფესიული მომზადებისა და გადამზადების მოკლევადიან საგანმანათლებლო პროგრამებს/კურსებს;
ე) აკადემიურ თანამდებობებზე მოიზიდავს წამყვან, დამწყებ თუ უკვე ცნობილ აქტიურ მეცნიერებს და მასწავლებლებს;
ვ) ქმნის სტუდენტებისათვის სწავლის, კვლევისა და განვითარებისათვის მაქსიმალურად მიმზიდველ გარემოს;
ზ) თავისი ბიუჯეტის მნიშვნელოვან ნაწილს ახმარს სასწავლო-კვლევითი პროგრამების განვითარებას;
თ) ქმნის სამეცნიერო კავშირებს როგორც ქვეყნის შიგნით, ისე საზღვარგარეთ;
ი) ახორციელებს საქართველოს კანონმდებლობით გათვალისწინებულ სხვა უფლებამოსილებებს.