სააგენტოს მიზნებია:
ა) სახელმწიფო მომსახურებების განვითარების ხელშეწყობა, ახალი და ინოვაციური სერვისების დანერგვა, ასევე, სახელმწიფო მომსახურების სფეროში, მნიშვნელოვანი პროექტებისა და რეფორმების მხარდაჭრა;
ბ) სამოქალაქო რეესტრის წარმოება და მუდმივი სრულყოფა;
გ) საქართველოს სხვა საკანონმდებლო და კანონქვემდებარე აქტებით განსაზღვრული ამოცანებისა და ფუნქციების განხორციელებ