1. სააგენტოს პირველადი სტრუქტურული ერთეულებია:
ა) სამოქალაქო რეესტრის დეპარტამენტი, რომლის მეორადი სტრუქტურული ერთეულებია:
ა.ა) დისტანციური მომსახურების სამმართველო;
ა.ბ) დოკუმენტების პერსონალიზაციის სამმართველო;
ა.გ) სამოქალაქო რეესტრის ხარისხის მართვისა და კოორდინაციის სამმართველო;
ა.დ) სამოქალაქო რეესტრის მონაცემების სრულყოფის სამმართველო;
ბ) მოქალაქეობისა და მიგრაციის დეპარტამენტი, რომლის მეორადი სტრუქტურული ერთეულებია:
ბ.ა) მოქალაქეობის საკითხთა სამმართველო;
ბ.ბ) მიგრაციის საკითხთა სამმართველო;
გ) აპოსტილისა და ლეგალიზაციის დეპარტამენტი, რომლის მეორადი სტრუქტურული ერთეულებია:
გ.ა) დოკუმენტების დამოწმების სამმართველო;
გ.ბ) დოკუმენტების თარგმნისა და საგანმანათლებლო სერვისების მხარდაჭერის სამმართველო;
დ) არქივების დეპარტამენტი, რომლის მეორადი სტრუქტურული ერთეულებია:
დ.ა) საინფორმაციო-სამისამართო სამმართველო;
დ.ბ) სამოქალაქო აქტების ცენტრალური არქივის სამმართველო;
დ.გ) სამოქალაქო აქტების რეგიონული არქივის სამმართველო;
ე) იურიდიული დეპარტამენტი, რომლის მეორადი სტრუქტურული ერთეულებია:
ე.ა) დავებისა და საჩივრების სამმართველო;
ე.ბ) სამართალშემოქმედების სამმართველო;
ვ) ადმინისტრაციული დეპარტამენტი, რომლის მეორადი სტრუქტურული ერთეულებია:
ვ.ა) ადამიანური რესურსების მართვის სამმართველო;
ვ.ბ) საქმისწარმოების სამმართველო;
ვ.გ) საზოგადოებასთან ურთიერთობის სამმართველო;
ზ) ეკონომიკური დეპარტამენტი, რომლის მეორადი სტრუქტურული ერთეულებია:
ზ.ა) შესყიდვების სამმართველო;
ზ.ბ) ლოჯისტიკის სამმართველო;
ზ.გ) საბუღალტრო აღრიცხვის სამმართველო;
ზ.დ) საფინანსო-საბიუჯეტო სამმართველო;
თ) ინფორმაციული ტექნოლოგიების განვითარების დეპარტამენტი, რომლის მეორადი სტრუქტურული ერთეულებია:
თ.ა) ინფორმაციული ტექნოლოგიების განვითარების ხელშეწყობის სამმართველო;
თ.ბ) პროგრამული უზრუნველყოფისა და საიდენტიფიკაციო სერვისების სამმართველო;
თ.გ) ინფორმაციული ტექნოლოგიების არქიტექტურისა და ინფრასტრუტურისა განვითარების სამმართველო;
ი) მონაცემთა ბაზებისა და ინფორმაციული ტექნოლოგიების ინფრასტრუქტურის მართვის დეპარტამენტი, რომლის მეორადი სტრუქტურული ერთეულებია:
ი.ა) გარე მომხმარებლებთან ურთიერთობის მართვის სამმართველო;
ი.ბ) ინფორმაციული ტექნოლოგიების ინფრასტრუქტურის მართვის სამმართველო;
ი.გ) ინფორმაციული ტექნოლოგიების მხარდაჭერის სამმართველო;
ი.დ) მონაცემთა ხარისხის მართვის სამმართველო;
კ) სერვისების განვითარებისა და ანალიტიკის დეპარტამენტი, რომლის სტრუქტურული ერთეულებია:
კ.ა) სერვისების განვითარებისა და ინოვაციების სამმართველო;
კ.ბ) ანალიტიკისა და სტატისტიკის სამმართველო.
ლ) მიგრაციის საკითხთა სამთავრობო კომისიის სამდივნო (სამსახური);
მ) შიდა კონტროლის სამსახური;
ნ) შიდა აუდიტის სამსახური.
2. სააგენტოში საქმიანობას ახორციელებენ სააგენტოს თავმჯდომარისადმი უშუალოდ დაქვემდებარებული თანამშრომლები:
ა) პერსონალურ მონაცემთა დაცვის ოფიცერი;
ბ) ინფორმაციული უსაფრთხოების მენეჯერ