1. ცენტრის საქმიანობაში მონაწილეობენ შემდეგი უწყებები:
ა) საქართველოს შინაგან საქმეთა სამინისტრო;
ბ) საქართველოს თავდაცვის სამინისტრო;
გ) საქართველოს საგარეო საქმეთა სამინისტრო;
დ) საქართველოს ფინანსთა სამინისტროს მმართველობის სფეროში შემავალი საჯარო სამართლის იურიდიული პირი – შემოსავლების სამსახური;
ე) საქართველოს ეკონომიკისა და მდგრადი განვითარების სამინისტროს სისტემაში შემავალი საჯარო სამართლის იურიდიული პირი – საზღვაო ტრანსპორტის სააგენტო;
ვ) საქართველოს გარემოს დაცვისა და სოფლის მეურნეობის სამინისტრო;
ზ) საქართველოს გარემოს დაცვისა და სოფლის მეურნეობის სამინისტროს სისტემაში შემავალი საჯარო სამართლის იურიდიული პირი – ბირთვული და რადიაციული უსაფრთხოების სააგენტო;
თ) საქართველოს დაზვერვის სამსახური;
ი) საქართველოს სახელმწიფო უსაფრთხოების სამსახური;
კ) საქართველოს ეკონომიკისა და მდგრადი განვითარების სამინისტროს სისტემაში შემავალი საჯარო სამართლის იურიდიული პირი − სამოქალაქო ავიაციის სააგენტო;
ლ) შეზღუდული პასუხისმგებლობის საზოგადოება „საქაერონავიგაცია“;
მ) საქართველოს ეკონომიკისა და მდგრადი განვითარების სამინისტროს სისტემაში შემავალი საჯარო სამართლის იურიდიული პირი – საქართველოს სახელმწიფო ჰიდროგრაფიული სამსახური.
2. ცენტრის საქმიანობაში მონაწილეობის მიზნით, მონაწილე უწყებები განსაზღვრავენ მუდმივ წარმომადგენლებს/ექსპერტებს, რომლებიც რჩებიან შესაბამისი მონაწილე უწყების მოსამსახურეებად და კომპეტენციის ფარგლებში მონაწილეობენ კონკრეტული საზღვაო ინციდენტის ან/და ერთობლივი საზღვაო ოპერაციების მართვაშ