საფინანსო-ეკონომიკური დეპარტამენტის ამოცანები და ფუნქციებია:
ა) ცენტრის მიერ გასატარებელი საფინანსო პოლიტიკის ძირითადი მიმართულებების შესწავლა და ორგანიზაციის ფინანსური პოლიტიკის შემუშავება;
ბ) ცენტრის ბიუჯეტის პროექტის შემუშავება;
გ) დამტკიცებული ბიუჯეტის მიზნობრივი ხარჯვისა და შესრულების ანალიზი;
დ) საერთაშორისო პროგრამების/პროექტების ფინანსური დაგეგმვა და შესრულება;
ე) პროდუქციის და მომსახურების ნორმატიული თვითღირებულების შედგენის სამუშაოების ორგანიზება და მართვა;
ვ) ფასების მასივის ფორმირება, გასაცემი ფასების მონაცემთა ბაზების ფორმირება;
ზ) შრომითი, ენერგო და მატერიალური დანახარჯების ნორმატიულ მონაცემთა ბაზების შექმნა ნაკეთობების მიხედვით;
თ) ნორმატიული და კრებსითი კალკულაციების შედგენა და გასაცემი ფასების დადგენა;
ი) შესრულებული სამუშაოს ხარჯთაღრიცხვის ანგარიშის მომზადება;
კ) კანონმდებლობით გათვალისწინებული შესაბამისი უფლებამოსილებებისა და ცენტრის ხელმძღვანელობის შესაბამისი დავალებების განხორციელებ