1. სააგენტო შედგება სტრუქტურული ერთეულებისა და ტერიტორიული ორგანოების – პრობაციის ბიუროებისგან, რომელთა მეშვეობით სააგენტო უზრუნველყოფს თავისი უფლებამოსილებების განხორციელებას.
2. სააგენტოს სტრუქტურული ერთეულებია:
ა) ადმინისტრაციული დეპარტამენტი;
ბ) ორგანიზაციული მხარდაჭერის დეპარტამენტი;
გ) ეკონომიკური დეპარტამენტი;
დ) მსჯავრდებულთა და ყოფილ პატიმართა რესოციალიზაცია-რეაბილიტაციის დეპარტამენტი;
ე) საზოგადოებასთან ურთიერთობის დეპარტამენტი;
ვ) კვლევისა და სერვისების დეპარტამენტი;
ზ) შიდა აუდიტის დეპარტამენტი;
თ) განრიდებისა და მედიაციის დეპარტამენტი;
ი) არასრულწლოვანთა რეფერირების ცენტრი.
3. სააგენტოს ტერიტორიული ორგანოებია:
ა) თბილისის პრობაციის ბიურო;
ბ) სამეგრელოსა და ზემო სვანეთის პრობაციის ბიურო;
გ) აჭარისა და გურიის პრობაციის ბიურო;
დ) იმერეთის პრობაციის ბიურო;
ე) რაჭა-ლეჩხუმისა და ქვემო სვანეთის პრობაციის ბიურო;
ვ) სამცხე-ჯავახეთის პრობაციის ბიურო;
ზ) შიდა ქართლის პრობაციის ბიურო;
თ) მცხეთა-მთიანეთის პრობაციის ბიურო;
ი) ქვემო ქართლის პრობაციის ბიურო;
კ) კახეთის პრობაციის ბიურ