ეკონომიკური სამსახურის ძირითადი ამოცანებია:

ა) სააგენტოს საფინანსო-ეკონომიკური და საბუღალტრო საქმიანობის კოორდინაცია და მართვა თანამედროვე სტანდარტების შესაბამისად;

ბ) სააგენტოს საბიუჯეტო პროცესის მართვის, კოორდინაციისა და კონტროლის უზრუნველყოფა;

გ) სააგენტოს სისტემაში ფულადი სახსრებისა და მატერიალურ ფასეულობათა მიზნობრივი დანიშნულებით გამოყენების კონტროლი;

დ) სააგენტოს კონსოლიდირებული ფინანსური ანგარიშგების (ბალანსის) შედგენა და დანიშნულების შესაბამისად წარდგენა;

ე) სააგენტოს მიერ განსახორციელებელი პროექტების წინასწარი ფინანსური ანალიზი;

ვ) ნაღდი და უნაღდო ფულადი ოპერაციების/ტრანზაქციების დროული წარმოება შესაბამისი დოკუმენტების საფუძველზე;

ზ) სააგენტოს სალაროს მეურნეობის გაძღოლა კანონმდებლობის შესაბამისად;

თ) მკაცრი აღრიცხვის დოკუმენტების ხარჯვის მონიტორინგი;

ი) სააგენტოს სახელმწიფო შესყიდვების დაგეგმვა, განხორციელება და ანგარიშგება;

კ) სახელმწიფო შესყიდვების პროცესების მართვა კანონმდებლობის განუხრელი დაცვით;

ლ) სააგენტოს მატერიალური ფასეულობების ინვენტარიზაციის ჩატარება, კანონით დადგენილი წესით;

მ) სახელმწიფო ბიუჯეტიდან მიღებული და კანონმდებლობით განსაზღვრული დაფინანსების სხვა წყაროების მიხედვით, სააგენტოს მარაგებისა და ნაკადების აღრიცხვა/ანგარიშგება;

ნ) სააგენტოს სტრუქტურული ერთეულების ორგანიზაციულ-სამეურნეო და სამუშაო პირობებით უზრუნველყოფა;

ო) სააგენტოს ბიუჯეტის ფორმირების მიზნით, საჭირო ინფორმაციის შეგროვება, პროგნოზირება, ბიუჯეტის პროექტის მომზადება, დამტკიცებული ბიუჯეტის შესრულების კვარტალური და წლიური ანგარიშის მომზადება/წარდგენა;

პ) სააგენტოს საშუალოვადიანი ბიუჯეტის დაგეგმვა და საპროგნოზო მაჩვენებლების მომზადება;

ჟ) სააგენტოს ინფრასტრუქტურისა და ბალანსზე რიცხული მატერიალური ფასეულობების დაცვის, შენახვის და მოვლა-პატრონობის უზრუნველყოფა;

რ) სამსახურის დებულებით განსაზღვრული და სამინისტროსგან შესაბამისი ადმინისტრაციული ხელშეკრულებით დელეგირებული საქმიანობის ფარგლებში სხვა უფლებამოსილებების განხორციელებ