მუზეუმების, მუზეუმ-ნაკრძალებისა და საგანმანათლებლო სამსახურის ძირითადი ამოცანებია:
ა) მუზეუმებისა და მუზეუმ-ნაკრძალების მართვის ზედამხედველობა;
ბ) კულტურული მემკვიდრეობის დაცვის, პოპულარიზაციისა და ორგანიზებული ტურიზმის ხელშეწყობის მიზნით, მიზნობრივი კულტურულ-საგანმანათლებლო და ტურისტული პროგრამების შემუშავება და განხორციელება;
გ) სააგენტოს საგამომცემლო საქმიანობის უზრუნველყოფა;
დ) სააგენტოს სტრუქტურაში მოქმედი მუზეუმებისა და მუზეუმ-ნაკრძალების საქმიანობის, სააგენტოს გეგმებისა და ამოცანების შესაბამისად კოორდინაცია;
ე) სამეცნიერო კვლევების საფუძველზე, ახალი და განახლებული მუზეუმების ან/და მუზეუმ-ნაკრძალებისათვის სამუზეუმო ექსპოზიციათა კონცეფციების შემუშავება;
ვ) სამუზეუმო სფეროს ექსპერტებთან თანამშრომლობა და კვლევითი, საკონსულტაციო, საექსპერტო საქმიანობის განხორციელების ხელშეწყობა;
ზ) მუზეუმებთან და მუზეუმ-ნაკრძალებთან დაკავშირებული შემეცნებითი, სამეცნიერო, სამეცნიერო-პოპულარული, საინფორმაციო ხასიათის გამოცემებისა და ღონისძიებების მომზადება-განხორციელება;
თ) სამსახურის დებულებით განსაზღვრული და სამინისტროსგან შესაბამისი ადმინისტრაციული ხელშეკრულებით დელეგირებული საქმიანობის ფარგლებში სხვა უფლებამოსილებების განხორციელებ